Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GRIK5Q16478 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GRIK5Q16478 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GRIK5Q16478 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GRIK5Q16478 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GRIK5Q16478 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
GRIK5Q16478 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GRIK5Q16478 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GRIK5Q16478 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GRIK5Q16478 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GRIK5Q16478 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GRIK5Q16478 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GRIK5Q16478 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GRIK5Q16478 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GRIK5Q16478 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GRIK5Q16478 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GRIK5Q16478 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIK5Q16478 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIK5Q16478 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIK5Q16478 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIK5Q16478 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIK5Q16478 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIK5Q16478 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIK5Q16478 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIK5Q16478 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIK5Q16478 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
GRIK5Q16478 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
GRIK5Q16478 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GRIK5Q16478 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GRIK5Q16478 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
GRIK5Q16478 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GRIK5Q16478 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GRIK5Q16478 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GRIK5Q16478 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GRIK5Q16478 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GRIK5Q16478 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GRIK5Q16478 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
GRIK5Q16478 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GRIK5Q16478 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GRIK5Q16478 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GRIK5Q16478 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GRIK5Q16478 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GRIK5Q16478 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GRIK5Q16478 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GRIK5Q16478 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GRIK5Q16478 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GRIK5Q16478 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GRIK5Q16478 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIK5Q16478 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIK5Q16478 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIK5Q16478 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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GRIK5Q16478 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIK5Q16478 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
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GRIK5Q16478 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GRIK5Q16478 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GRIK5Q16478 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GRIK5Q16478 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GRIK5Q16478 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GRIK5Q16478 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GRIK5Q16478 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
GRIK5Q16478 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GRIK5Q16478 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GRIK5Q16478 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GRIK5Q16478 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GRIK5Q16478 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GRIK5Q16478 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GRIK5Q16478 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GRIK5Q16478 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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GRIK5Q16478 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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GRIK5Q16478 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GRIK5Q16478 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GRIK5Q16478 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GRIK5Q16478 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GRIK5Q16478 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GRIK5Q16478 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GRIK5Q16478 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GRIK5Q16478 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GRIK5Q16478 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GRIK5Q16478 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
GRIK5Q16478 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
GRIK5Q16478 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GRIK5Q16478 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GRIK5Q16478 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GRIK5Q16478 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
GRIK5Q16478 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GRIK5Q16478 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GRIK5Q16478 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GRIK5Q16478 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GRIK5Q16478 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
GRIK5Q16478 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GRIK5Q16478 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GRIK5Q16478 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GRIK5Q16478 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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