Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
ZFHX3Q15911 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
ZFHX3Q15911 RNU6-1277P-201ENST00000364561 107 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
ZFHX3Q15911 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
ZFHX3Q15911 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
ZFHX3Q15911 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
ZFHX3Q15911 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
ZFHX3Q15911 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
ZFHX3Q15911 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
ZFHX3Q15911 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
ZFHX3Q15911 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
ZFHX3Q15911 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
ZFHX3Q15911 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC-2.11□□□□□ -2.75
ZFHX3Q15911 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
ZFHX3Q15911 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
ZFHX3Q15911 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
ZFHX3Q15911 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
ZFHX3Q15911 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
ZFHX3Q15911 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
ZFHX3Q15911 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
ZFHX3Q15911 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
ZFHX3Q15911 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
ZFHX3Q15911 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
ZFHX3Q15911 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
ZFHX3Q15911 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
ZFHX3Q15911 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
ZFHX3Q15911 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
ZFHX3Q15911 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
ZFHX3Q15911 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
ZFHX3Q15911 RNU6-1161P-201ENST00000516176 102 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
ZFHX3Q15911 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
ZFHX3Q15911 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
ZFHX3Q15911 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
ZFHX3Q15911 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
ZFHX3Q15911 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
ZFHX3Q15911 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
ZFHX3Q15911 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
ZFHX3Q15911 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
ZFHX3Q15911 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
ZFHX3Q15911 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
ZFHX3Q15911 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
ZFHX3Q15911 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
ZFHX3Q15911 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
ZFHX3Q15911 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
ZFHX3Q15911 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
ZFHX3Q15911 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC-2.15□□□□□ -2.75
ZFHX3Q15911 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
ZFHX3Q15911 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC-2.15□□□□□ -2.75
ZFHX3Q15911 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
ZFHX3Q15911 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
ZFHX3Q15911 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
ZFHX3Q15911 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
ZFHX3Q15911 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
ZFHX3Q15911 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
ZFHX3Q15911 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
ZFHX3Q15911 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
ZFHX3Q15911 MIR363-201ENST00000384840 75 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
ZFHX3Q15911 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC-2.16□□□□□ -2.75
ZFHX3Q15911 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
ZFHX3Q15911 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
ZFHX3Q15911 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
ZFHX3Q15911 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.8 ms