Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SCN9AQ15858 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SCN9AQ15858 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SCN9AQ15858 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SCN9AQ15858 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SCN9AQ15858 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SCN9AQ15858 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SCN9AQ15858 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SCN9AQ15858 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SCN9AQ15858 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SCN9AQ15858 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SCN9AQ15858 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SCN9AQ15858 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SCN9AQ15858 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SCN9AQ15858 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SCN9AQ15858 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SCN9AQ15858 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SCN9AQ15858 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SCN9AQ15858 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SCN9AQ15858 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SCN9AQ15858 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SCN9AQ15858 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SCN9AQ15858 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SCN9AQ15858 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SCN9AQ15858 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SCN9AQ15858 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SCN9AQ15858 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SCN9AQ15858 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SCN9AQ15858 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SCN9AQ15858 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SCN9AQ15858 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SCN9AQ15858 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SCN9AQ15858 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SCN9AQ15858 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SCN9AQ15858 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SCN9AQ15858 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SCN9AQ15858 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SCN9AQ15858 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SCN9AQ15858 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SCN9AQ15858 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SCN9AQ15858 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SCN9AQ15858 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SCN9AQ15858 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SCN9AQ15858 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SCN9AQ15858 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SCN9AQ15858 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SCN9AQ15858 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SCN9AQ15858 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SCN9AQ15858 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SCN9AQ15858 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SCN9AQ15858 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SCN9AQ15858 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SCN9AQ15858 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SCN9AQ15858 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SCN9AQ15858 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SCN9AQ15858 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SCN9AQ15858 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SCN9AQ15858 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SCN9AQ15858 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SCN9AQ15858 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SCN9AQ15858 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SCN9AQ15858 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SCN9AQ15858 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SCN9AQ15858 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SCN9AQ15858 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC-0.95□□□□□ -2.56
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SCN9AQ15858 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SCN9AQ15858 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.96□□□□□ -2.56
SCN9AQ15858 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SCN9AQ15858 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SCN9AQ15858 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SCN9AQ15858 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
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SCN9AQ15858 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
SCN9AQ15858 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
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SCN9AQ15858 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
SCN9AQ15858 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
SCN9AQ15858 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
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SCN9AQ15858 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
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SCN9AQ15858 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
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SCN9AQ15858 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SCN9AQ15858 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SCN9AQ15858 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SCN9AQ15858 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
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