Protein–RNA interactions for Protein: Q15526

SURF1, Surfeit locus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1Q15526 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SURF1Q15526 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SURF1Q15526 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SURF1Q15526 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SURF1Q15526 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SURF1Q15526 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SURF1Q15526 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SURF1Q15526 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SURF1Q15526 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SURF1Q15526 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SURF1Q15526 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SURF1Q15526 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SURF1Q15526 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SURF1Q15526 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SURF1Q15526 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SURF1Q15526 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SURF1Q15526 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SURF1Q15526 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SURF1Q15526 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SURF1Q15526 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SURF1Q15526 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SURF1Q15526 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SURF1Q15526 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SURF1Q15526 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SURF1Q15526 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SURF1Q15526 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SURF1Q15526 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SURF1Q15526 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SURF1Q15526 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SURF1Q15526 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SURF1Q15526 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SURF1Q15526 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SURF1Q15526 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SURF1Q15526 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SURF1Q15526 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
SURF1Q15526 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SURF1Q15526 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
SURF1Q15526 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SURF1Q15526 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SURF1Q15526 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SURF1Q15526 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SURF1Q15526 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SURF1Q15526 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SURF1Q15526 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SURF1Q15526 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SURF1Q15526 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
SURF1Q15526 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SURF1Q15526 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SURF1Q15526 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SURF1Q15526 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SURF1Q15526 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SURF1Q15526 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SURF1Q15526 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SURF1Q15526 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SURF1Q15526 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SURF1Q15526 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SURF1Q15526 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SURF1Q15526 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SURF1Q15526 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SURF1Q15526 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SURF1Q15526 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SURF1Q15526 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SURF1Q15526 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SURF1Q15526 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SURF1Q15526 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SURF1Q15526 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SURF1Q15526 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
SURF1Q15526 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SURF1Q15526 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SURF1Q15526 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SURF1Q15526 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SURF1Q15526 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SURF1Q15526 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SURF1Q15526 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SURF1Q15526 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SURF1Q15526 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SURF1Q15526 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SURF1Q15526 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SURF1Q15526 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SURF1Q15526 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SURF1Q15526 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SURF1Q15526 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SURF1Q15526 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SURF1Q15526 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SURF1Q15526 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SURF1Q15526 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SURF1Q15526 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SURF1Q15526 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SURF1Q15526 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
SURF1Q15526 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SURF1Q15526 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SURF1Q15526 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SURF1Q15526 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SURF1Q15526 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SURF1Q15526 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SURF1Q15526 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SURF1Q15526 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SURF1Q15526 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SURF1Q15526 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SURF1Q15526 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
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