Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PRKD1Q15139 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PRKD1Q15139 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PRKD1Q15139 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PRKD1Q15139 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PRKD1Q15139 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PRKD1Q15139 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PRKD1Q15139 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PRKD1Q15139 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PRKD1Q15139 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PRKD1Q15139 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PRKD1Q15139 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PRKD1Q15139 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
PRKD1Q15139 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PRKD1Q15139 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PRKD1Q15139 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PRKD1Q15139 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PRKD1Q15139 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
PRKD1Q15139 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PRKD1Q15139 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PRKD1Q15139 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PRKD1Q15139 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PRKD1Q15139 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PRKD1Q15139 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PRKD1Q15139 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PRKD1Q15139 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PRKD1Q15139 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PRKD1Q15139 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PRKD1Q15139 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PRKD1Q15139 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PRKD1Q15139 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PRKD1Q15139 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PRKD1Q15139 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PRKD1Q15139 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PRKD1Q15139 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PRKD1Q15139 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PRKD1Q15139 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
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