Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SPIDRQ14159 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SPIDRQ14159 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SPIDRQ14159 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SPIDRQ14159 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SPIDRQ14159 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SPIDRQ14159 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SPIDRQ14159 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SPIDRQ14159 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SPIDRQ14159 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SPIDRQ14159 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SPIDRQ14159 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SPIDRQ14159 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SPIDRQ14159 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SPIDRQ14159 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SPIDRQ14159 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SPIDRQ14159 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SPIDRQ14159 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SPIDRQ14159 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SPIDRQ14159 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SPIDRQ14159 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SPIDRQ14159 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SPIDRQ14159 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SPIDRQ14159 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SPIDRQ14159 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SPIDRQ14159 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SPIDRQ14159 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SPIDRQ14159 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SPIDRQ14159 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SPIDRQ14159 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SPIDRQ14159 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SPIDRQ14159 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SPIDRQ14159 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SPIDRQ14159 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SPIDRQ14159 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SPIDRQ14159 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SPIDRQ14159 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SPIDRQ14159 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SPIDRQ14159 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SPIDRQ14159 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SPIDRQ14159 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SPIDRQ14159 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SPIDRQ14159 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SPIDRQ14159 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SPIDRQ14159 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SPIDRQ14159 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SPIDRQ14159 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SPIDRQ14159 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SPIDRQ14159 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SPIDRQ14159 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SPIDRQ14159 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SPIDRQ14159 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SPIDRQ14159 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SPIDRQ14159 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SPIDRQ14159 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SPIDRQ14159 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SPIDRQ14159 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SPIDRQ14159 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SPIDRQ14159 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SPIDRQ14159 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SPIDRQ14159 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SPIDRQ14159 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SPIDRQ14159 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SPIDRQ14159 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SPIDRQ14159 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SPIDRQ14159 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SPIDRQ14159 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SPIDRQ14159 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SPIDRQ14159 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SPIDRQ14159 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SPIDRQ14159 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SPIDRQ14159 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SPIDRQ14159 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SPIDRQ14159 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SPIDRQ14159 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SPIDRQ14159 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SPIDRQ14159 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SPIDRQ14159 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SPIDRQ14159 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SPIDRQ14159 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SPIDRQ14159 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SPIDRQ14159 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SPIDRQ14159 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SPIDRQ14159 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
SPIDRQ14159 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
SPIDRQ14159 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SPIDRQ14159 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SPIDRQ14159 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SPIDRQ14159 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SPIDRQ14159 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SPIDRQ14159 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SPIDRQ14159 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SPIDRQ14159 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SPIDRQ14159 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SPIDRQ14159 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SPIDRQ14159 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SPIDRQ14159 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SPIDRQ14159 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SPIDRQ14159 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SPIDRQ14159 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 197.6 ms