Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRIM28Q13263 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRIM28Q13263 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRIM28Q13263 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRIM28Q13263 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRIM28Q13263 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRIM28Q13263 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRIM28Q13263 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TRIM28Q13263 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
TRIM28Q13263 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRIM28Q13263 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRIM28Q13263 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRIM28Q13263 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRIM28Q13263 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRIM28Q13263 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRIM28Q13263 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TRIM28Q13263 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TRIM28Q13263 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TRIM28Q13263 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
TRIM28Q13263 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
TRIM28Q13263 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
TRIM28Q13263 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TRIM28Q13263 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TRIM28Q13263 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TRIM28Q13263 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TRIM28Q13263 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TRIM28Q13263 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TRIM28Q13263 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
TRIM28Q13263 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TRIM28Q13263 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
TRIM28Q13263 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TRIM28Q13263 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TRIM28Q13263 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TRIM28Q13263 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TRIM28Q13263 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TRIM28Q13263 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TRIM28Q13263 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TRIM28Q13263 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TRIM28Q13263 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TRIM28Q13263 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TRIM28Q13263 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TRIM28Q13263 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TRIM28Q13263 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
TRIM28Q13263 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TRIM28Q13263 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TRIM28Q13263 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TRIM28Q13263 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TRIM28Q13263 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TRIM28Q13263 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TRIM28Q13263 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TRIM28Q13263 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TRIM28Q13263 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TRIM28Q13263 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TRIM28Q13263 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TRIM28Q13263 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TRIM28Q13263 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TRIM28Q13263 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TRIM28Q13263 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TRIM28Q13263 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TRIM28Q13263 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TRIM28Q13263 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TRIM28Q13263 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TRIM28Q13263 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TRIM28Q13263 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TRIM28Q13263 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TRIM28Q13263 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TRIM28Q13263 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
TRIM28Q13263 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRIM28Q13263 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRIM28Q13263 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRIM28Q13263 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRIM28Q13263 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TRIM28Q13263 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRIM28Q13263 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRIM28Q13263 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRIM28Q13263 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TRIM28Q13263 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
TRIM28Q13263 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TRIM28Q13263 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
TRIM28Q13263 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
TRIM28Q13263 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TRIM28Q13263 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TRIM28Q13263 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TRIM28Q13263 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TRIM28Q13263 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TRIM28Q13263 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TRIM28Q13263 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TRIM28Q13263 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
TRIM28Q13263 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TRIM28Q13263 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TRIM28Q13263 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TRIM28Q13263 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TRIM28Q13263 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TRIM28Q13263 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TRIM28Q13263 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TRIM28Q13263 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TRIM28Q13263 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TRIM28Q13263 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TRIM28Q13263 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TRIM28Q13263 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.09
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