Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TRAF3Q13114 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TRAF3Q13114 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
TRAF3Q13114 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TRAF3Q13114 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TRAF3Q13114 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TRAF3Q13114 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
TRAF3Q13114 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TRAF3Q13114 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TRAF3Q13114 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TRAF3Q13114 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TRAF3Q13114 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TRAF3Q13114 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TRAF3Q13114 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TRAF3Q13114 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TRAF3Q13114 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
TRAF3Q13114 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TRAF3Q13114 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TRAF3Q13114 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TRAF3Q13114 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TRAF3Q13114 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TRAF3Q13114 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TRAF3Q13114 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TRAF3Q13114 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TRAF3Q13114 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.77□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TRAF3Q13114 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TRAF3Q13114 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TRAF3Q13114 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TRAF3Q13114 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TRAF3Q13114 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TRAF3Q13114 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TRAF3Q13114 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TRAF3Q13114 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TRAF3Q13114 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TRAF3Q13114 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAF3Q13114 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAF3Q13114 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAF3Q13114 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAF3Q13114 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAF3Q13114 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAF3Q13114 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAF3Q13114 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAF3Q13114 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 197.8 ms