Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
FOXD4Q12950 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
FOXD4Q12950 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
FOXD4Q12950 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
FOXD4Q12950 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
FOXD4Q12950 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
FOXD4Q12950 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
FOXD4Q12950 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
FOXD4Q12950 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
FOXD4Q12950 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
FOXD4Q12950 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
FOXD4Q12950 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
FOXD4Q12950 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
FOXD4Q12950 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
FOXD4Q12950 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
FOXD4Q12950 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
FOXD4Q12950 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
FOXD4Q12950 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
FOXD4Q12950 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
FOXD4Q12950 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
FOXD4Q12950 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
FOXD4Q12950 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
FOXD4Q12950 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
FOXD4Q12950 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
FOXD4Q12950 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
FOXD4Q12950 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
FOXD4Q12950 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
FOXD4Q12950 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
FOXD4Q12950 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
FOXD4Q12950 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
FOXD4Q12950 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
FOXD4Q12950 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
FOXD4Q12950 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
FOXD4Q12950 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
FOXD4Q12950 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
FOXD4Q12950 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
FOXD4Q12950 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
FOXD4Q12950 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
FOXD4Q12950 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
FOXD4Q12950 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
FOXD4Q12950 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
FOXD4Q12950 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
FOXD4Q12950 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
FOXD4Q12950 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
FOXD4Q12950 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
FOXD4Q12950 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
FOXD4Q12950 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
FOXD4Q12950 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
FOXD4Q12950 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
FOXD4Q12950 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
FOXD4Q12950 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
FOXD4Q12950 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
FOXD4Q12950 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
FOXD4Q12950 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
FOXD4Q12950 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
FOXD4Q12950 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
FOXD4Q12950 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
FOXD4Q12950 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
FOXD4Q12950 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
FOXD4Q12950 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
FOXD4Q12950 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
FOXD4Q12950 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
FOXD4Q12950 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
FOXD4Q12950 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
FOXD4Q12950 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
FOXD4Q12950 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
FOXD4Q12950 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
FOXD4Q12950 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
FOXD4Q12950 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
FOXD4Q12950 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
FOXD4Q12950 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
FOXD4Q12950 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
FOXD4Q12950 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
FOXD4Q12950 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
FOXD4Q12950 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
FOXD4Q12950 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
FOXD4Q12950 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
FOXD4Q12950 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
FOXD4Q12950 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
FOXD4Q12950 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
FOXD4Q12950 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
FOXD4Q12950 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
FOXD4Q12950 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
FOXD4Q12950 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
FOXD4Q12950 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
FOXD4Q12950 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
FOXD4Q12950 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
FOXD4Q12950 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
FOXD4Q12950 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
FOXD4Q12950 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
FOXD4Q12950 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
FOXD4Q12950 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
FOXD4Q12950 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
FOXD4Q12950 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
FOXD4Q12950 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
FOXD4Q12950 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
FOXD4Q12950 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
FOXD4Q12950 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
FOXD4Q12950 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
FOXD4Q12950 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
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