Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
NUP160Q12769 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
NUP160Q12769 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
NUP160Q12769 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
NUP160Q12769 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
NUP160Q12769 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
NUP160Q12769 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
NUP160Q12769 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
NUP160Q12769 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
NUP160Q12769 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
NUP160Q12769 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
NUP160Q12769 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
NUP160Q12769 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
NUP160Q12769 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
NUP160Q12769 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
NUP160Q12769 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
NUP160Q12769 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
NUP160Q12769 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
NUP160Q12769 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
NUP160Q12769 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
NUP160Q12769 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
NUP160Q12769 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
NUP160Q12769 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
NUP160Q12769 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
NUP160Q12769 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
NUP160Q12769 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
NUP160Q12769 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
NUP160Q12769 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
NUP160Q12769 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
NUP160Q12769 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
NUP160Q12769 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
NUP160Q12769 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
NUP160Q12769 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
NUP160Q12769 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
NUP160Q12769 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
NUP160Q12769 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
NUP160Q12769 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC-1.23□□□□□ -2.61
NUP160Q12769 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-1.23□□□□□ -2.61
NUP160Q12769 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
NUP160Q12769 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
NUP160Q12769 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
NUP160Q12769 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
NUP160Q12769 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
NUP160Q12769 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
NUP160Q12769 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
NUP160Q12769 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
NUP160Q12769 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
NUP160Q12769 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
NUP160Q12769 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
NUP160Q12769 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
NUP160Q12769 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
NUP160Q12769 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
NUP160Q12769 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
NUP160Q12769 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
NUP160Q12769 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
NUP160Q12769 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
NUP160Q12769 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
NUP160Q12769 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
NUP160Q12769 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
NUP160Q12769 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
NUP160Q12769 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
NUP160Q12769 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
NUP160Q12769 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
NUP160Q12769 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
NUP160Q12769 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
NUP160Q12769 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
NUP160Q12769 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
NUP160Q12769 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
NUP160Q12769 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
NUP160Q12769 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
NUP160Q12769 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
NUP160Q12769 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
NUP160Q12769 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
NUP160Q12769 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
NUP160Q12769 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC-1.28□□□□□ -2.61
NUP160Q12769 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
NUP160Q12769 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
NUP160Q12769 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
NUP160Q12769 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC-1.28□□□□□ -2.61
NUP160Q12769 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
NUP160Q12769 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
NUP160Q12769 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
NUP160Q12769 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
NUP160Q12769 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
NUP160Q12769 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
NUP160Q12769 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
NUP160Q12769 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
NUP160Q12769 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
NUP160Q12769 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
NUP160Q12769 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
NUP160Q12769 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
NUP160Q12769 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
NUP160Q12769 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
NUP160Q12769 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
NUP160Q12769 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
NUP160Q12769 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
NUP160Q12769 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
NUP160Q12769 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
NUP160Q12769 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
NUP160Q12769 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 189.9 ms