Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PITX1P78337 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PITX1P78337 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PITX1P78337 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PITX1P78337 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PITX1P78337 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
PITX1P78337 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PITX1P78337 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PITX1P78337 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PITX1P78337 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PITX1P78337 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PITX1P78337 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PITX1P78337 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PITX1P78337 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PITX1P78337 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PITX1P78337 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PITX1P78337 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
PITX1P78337 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PITX1P78337 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PITX1P78337 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PITX1P78337 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PITX1P78337 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PITX1P78337 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PITX1P78337 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PITX1P78337 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PITX1P78337 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PITX1P78337 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PITX1P78337 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PITX1P78337 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PITX1P78337 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PITX1P78337 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PITX1P78337 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PITX1P78337 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PITX1P78337 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PITX1P78337 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PITX1P78337 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PITX1P78337 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PITX1P78337 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PITX1P78337 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PITX1P78337 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PITX1P78337 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PITX1P78337 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PITX1P78337 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PITX1P78337 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PITX1P78337 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PITX1P78337 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PITX1P78337 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PITX1P78337 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PITX1P78337 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PITX1P78337 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PITX1P78337 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PITX1P78337 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PITX1P78337 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PITX1P78337 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PITX1P78337 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PITX1P78337 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PITX1P78337 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PITX1P78337 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PITX1P78337 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PITX1P78337 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PITX1P78337 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PITX1P78337 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PITX1P78337 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PITX1P78337 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PITX1P78337 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PITX1P78337 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PITX1P78337 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PITX1P78337 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PITX1P78337 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PITX1P78337 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PITX1P78337 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC0.61□□□□□ -2.31
PITX1P78337 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PITX1P78337 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PITX1P78337 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PITX1P78337 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PITX1P78337 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PITX1P78337 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PITX1P78337 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PITX1P78337 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PITX1P78337 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PITX1P78337 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PITX1P78337 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PITX1P78337 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PITX1P78337 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PITX1P78337 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PITX1P78337 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PITX1P78337 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PITX1P78337 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PITX1P78337 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PITX1P78337 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PITX1P78337 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PITX1P78337 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PITX1P78337 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PITX1P78337 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
PITX1P78337 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PITX1P78337 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PITX1P78337 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PITX1P78337 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PITX1P78337 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PITX1P78337 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 258.3 ms