Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CASQ1P31415 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CASQ1P31415 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CASQ1P31415 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CASQ1P31415 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-1.49□□□□□ -2.65
CASQ1P31415 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CASQ1P31415 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CASQ1P31415 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CASQ1P31415 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CASQ1P31415 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CASQ1P31415 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CASQ1P31415 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CASQ1P31415 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CASQ1P31415 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CASQ1P31415 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CASQ1P31415 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CASQ1P31415 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CASQ1P31415 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CASQ1P31415 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CASQ1P31415 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CASQ1P31415 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CASQ1P31415 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CASQ1P31415 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CASQ1P31415 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CASQ1P31415 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CASQ1P31415 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CASQ1P31415 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC-1.53□□□□□ -2.65
CASQ1P31415 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CASQ1P31415 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CASQ1P31415 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CASQ1P31415 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CASQ1P31415 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CASQ1P31415 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CASQ1P31415 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CASQ1P31415 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CASQ1P31415 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CASQ1P31415 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CASQ1P31415 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CASQ1P31415 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CASQ1P31415 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CASQ1P31415 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CASQ1P31415 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CASQ1P31415 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CASQ1P31415 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CASQ1P31415 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CASQ1P31415 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CASQ1P31415 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CASQ1P31415 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CASQ1P31415 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CASQ1P31415 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CASQ1P31415 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CASQ1P31415 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CASQ1P31415 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC-1.57□□□□□ -2.66
CASQ1P31415 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CASQ1P31415 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CASQ1P31415 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CASQ1P31415 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CASQ1P31415 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CASQ1P31415 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CASQ1P31415 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CASQ1P31415 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CASQ1P31415 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CASQ1P31415 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CASQ1P31415 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CASQ1P31415 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CASQ1P31415 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CASQ1P31415 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CASQ1P31415 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CASQ1P31415 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CASQ1P31415 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CASQ1P31415 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CASQ1P31415 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CASQ1P31415 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
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CASQ1P31415 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
CASQ1P31415 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
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CASQ1P31415 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
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CASQ1P31415 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
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CASQ1P31415 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CASQ1P31415 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
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CASQ1P31415 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CASQ1P31415 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CASQ1P31415 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CASQ1P31415 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CASQ1P31415 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CASQ1P31415 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CASQ1P31415 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
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