Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPREP23469 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPREP23469 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
PTPREP23469 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPREP23469 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPREP23469 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPREP23469 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPREP23469 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPREP23469 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPREP23469 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPREP23469 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPREP23469 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPREP23469 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPREP23469 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPREP23469 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPREP23469 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPREP23469 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPREP23469 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPREP23469 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPREP23469 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPREP23469 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPREP23469 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPREP23469 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPREP23469 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPREP23469 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPREP23469 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPREP23469 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPREP23469 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPREP23469 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPREP23469 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPREP23469 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPREP23469 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPREP23469 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPREP23469 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPREP23469 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPREP23469 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPREP23469 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPREP23469 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPREP23469 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPREP23469 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPREP23469 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPREP23469 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPREP23469 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPREP23469 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPREP23469 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPREP23469 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPREP23469 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPREP23469 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPREP23469 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPREP23469 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPREP23469 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
PTPREP23469 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPREP23469 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPREP23469 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPREP23469 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPREP23469 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPREP23469 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPREP23469 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPREP23469 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPREP23469 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPREP23469 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPREP23469 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPREP23469 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PTPREP23469 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPREP23469 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPREP23469 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PTPREP23469 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPREP23469 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPREP23469 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPREP23469 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPREP23469 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPREP23469 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPREP23469 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPREP23469 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPREP23469 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPREP23469 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PTPREP23469 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPREP23469 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPREP23469 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTPREP23469 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPREP23469 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PTPREP23469 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PTPREP23469 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPREP23469 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPREP23469 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPREP23469 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPREP23469 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPREP23469 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPREP23469 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPREP23469 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTPREP23469 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPREP23469 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPREP23469 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPREP23469 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPREP23469 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPREP23469 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTPREP23469 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPREP23469 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPREP23469 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPREP23469 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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