Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
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NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
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NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
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NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
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