Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
EHD3Q9NZN3 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
EHD3Q9NZN3 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
EHD3Q9NZN3 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
EHD3Q9NZN3 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
EHD3Q9NZN3 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
EHD3Q9NZN3 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
EHD3Q9NZN3 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
EHD3Q9NZN3 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
EHD3Q9NZN3 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
EHD3Q9NZN3 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
EHD3Q9NZN3 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
EHD3Q9NZN3 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
EHD3Q9NZN3 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
EHD3Q9NZN3 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
EHD3Q9NZN3 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
EHD3Q9NZN3 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
EHD3Q9NZN3 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
EHD3Q9NZN3 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
EHD3Q9NZN3 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
EHD3Q9NZN3 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
EHD3Q9NZN3 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
EHD3Q9NZN3 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
EHD3Q9NZN3 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
EHD3Q9NZN3 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
EHD3Q9NZN3 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
EHD3Q9NZN3 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
EHD3Q9NZN3 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
EHD3Q9NZN3 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
EHD3Q9NZN3 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
EHD3Q9NZN3 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
EHD3Q9NZN3 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
EHD3Q9NZN3 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
EHD3Q9NZN3 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
EHD3Q9NZN3 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
EHD3Q9NZN3 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
EHD3Q9NZN3 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
EHD3Q9NZN3 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
EHD3Q9NZN3 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
EHD3Q9NZN3 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
EHD3Q9NZN3 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
EHD3Q9NZN3 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
EHD3Q9NZN3 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
EHD3Q9NZN3 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
EHD3Q9NZN3 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
EHD3Q9NZN3 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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