Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ZBED3Q96IU2 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ZBED3Q96IU2 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ZBED3Q96IU2 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ZBED3Q96IU2 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ZBED3Q96IU2 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ZBED3Q96IU2 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ZBED3Q96IU2 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ZBED3Q96IU2 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ZBED3Q96IU2 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ZBED3Q96IU2 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ZBED3Q96IU2 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ZBED3Q96IU2 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ZBED3Q96IU2 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ZBED3Q96IU2 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ZBED3Q96IU2 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ZBED3Q96IU2 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ZBED3Q96IU2 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ZBED3Q96IU2 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ZBED3Q96IU2 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ZBED3Q96IU2 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ZBED3Q96IU2 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ZBED3Q96IU2 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ZBED3Q96IU2 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ZBED3Q96IU2 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ZBED3Q96IU2 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ZBED3Q96IU2 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ZBED3Q96IU2 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ZBED3Q96IU2 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ZBED3Q96IU2 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ZBED3Q96IU2 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ZBED3Q96IU2 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ZBED3Q96IU2 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ZBED3Q96IU2 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ZBED3Q96IU2 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ZBED3Q96IU2 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ZBED3Q96IU2 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ZBED3Q96IU2 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ZBED3Q96IU2 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ZBED3Q96IU2 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ZBED3Q96IU2 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ZBED3Q96IU2 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ZBED3Q96IU2 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ZBED3Q96IU2 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.25□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 214.2 ms