Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.81□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SCN9AQ15858 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SCN9AQ15858 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SCN9AQ15858 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SCN9AQ15858 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SCN9AQ15858 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SCN9AQ15858 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SCN9AQ15858 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SCN9AQ15858 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SCN9AQ15858 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SCN9AQ15858 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SCN9AQ15858 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SCN9AQ15858 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SCN9AQ15858 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SCN9AQ15858 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SCN9AQ15858 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SCN9AQ15858 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SCN9AQ15858 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SCN9AQ15858 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SCN9AQ15858 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SCN9AQ15858 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SCN9AQ15858 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SCN9AQ15858 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SCN9AQ15858 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SCN9AQ15858 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SCN9AQ15858 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SCN9AQ15858 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SCN9AQ15858 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SCN9AQ15858 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SCN9AQ15858 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SCN9AQ15858 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SCN9AQ15858 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SCN9AQ15858 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SCN9AQ15858 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SCN9AQ15858 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SCN9AQ15858 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SCN9AQ15858 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
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