Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SEC23BQ15437 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SEC23BQ15437 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SEC23BQ15437 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SEC23BQ15437 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.25
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SEC23BQ15437 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SEC23BQ15437 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SEC23BQ15437 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SEC23BQ15437 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SEC23BQ15437 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SEC23BQ15437 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SEC23BQ15437 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SEC23BQ15437 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SEC23BQ15437 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SEC23BQ15437 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SEC23BQ15437 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SEC23BQ15437 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SEC23BQ15437 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SEC23BQ15437 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SEC23BQ15437 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SEC23BQ15437 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SEC23BQ15437 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SEC23BQ15437 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SEC23BQ15437 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SEC23BQ15437 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SEC23BQ15437 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SEC23BQ15437 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SEC23BQ15437 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SEC23BQ15437 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SEC23BQ15437 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SEC23BQ15437 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SEC23BQ15437 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SEC23BQ15437 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SEC23BQ15437 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
SEC23BQ15437 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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SEC23BQ15437 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SEC23BQ15437 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SEC23BQ15437 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SEC23BQ15437 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SEC23BQ15437 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SEC23BQ15437 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SEC23BQ15437 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SEC23BQ15437 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SEC23BQ15437 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SEC23BQ15437 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SEC23BQ15437 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SEC23BQ15437 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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SEC23BQ15437 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
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SEC23BQ15437 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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SEC23BQ15437 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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SEC23BQ15437 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
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SEC23BQ15437 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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SEC23BQ15437 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SEC23BQ15437 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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SEC23BQ15437 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
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SEC23BQ15437 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
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SEC23BQ15437 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
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SEC23BQ15437 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
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SEC23BQ15437 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SEC23BQ15437 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SEC23BQ15437 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SEC23BQ15437 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SEC23BQ15437 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SEC23BQ15437 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SEC23BQ15437 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SEC23BQ15437 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SEC23BQ15437 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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