Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PTP4A2Q12974 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTP4A2Q12974 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTP4A2Q12974 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTP4A2Q12974 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTP4A2Q12974 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTP4A2Q12974 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTP4A2Q12974 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTP4A2Q12974 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTP4A2Q12974 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTP4A2Q12974 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTP4A2Q12974 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTP4A2Q12974 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTP4A2Q12974 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTP4A2Q12974 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PTP4A2Q12974 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTP4A2Q12974 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTP4A2Q12974 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTP4A2Q12974 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTP4A2Q12974 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTP4A2Q12974 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTP4A2Q12974 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTP4A2Q12974 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTP4A2Q12974 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTP4A2Q12974 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTP4A2Q12974 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTP4A2Q12974 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTP4A2Q12974 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTP4A2Q12974 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTP4A2Q12974 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTP4A2Q12974 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTP4A2Q12974 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTP4A2Q12974 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTP4A2Q12974 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTP4A2Q12974 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTP4A2Q12974 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTP4A2Q12974 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTP4A2Q12974 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTP4A2Q12974 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTP4A2Q12974 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTP4A2Q12974 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTP4A2Q12974 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTP4A2Q12974 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTP4A2Q12974 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTP4A2Q12974 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTP4A2Q12974 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTP4A2Q12974 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTP4A2Q12974 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTP4A2Q12974 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTP4A2Q12974 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTP4A2Q12974 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTP4A2Q12974 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTP4A2Q12974 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTP4A2Q12974 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTP4A2Q12974 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTP4A2Q12974 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTP4A2Q12974 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTP4A2Q12974 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.31□□□□□ -2.36
PTP4A2Q12974 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTP4A2Q12974 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTP4A2Q12974 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTP4A2Q12974 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTP4A2Q12974 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
PTP4A2Q12974 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.28□□□□□ -2.36
PTP4A2Q12974 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTP4A2Q12974 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTP4A2Q12974 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTP4A2Q12974 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTP4A2Q12974 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTP4A2Q12974 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTP4A2Q12974 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTP4A2Q12974 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTP4A2Q12974 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTP4A2Q12974 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTP4A2Q12974 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTP4A2Q12974 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTP4A2Q12974 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTP4A2Q12974 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTP4A2Q12974 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTP4A2Q12974 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTP4A2Q12974 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTP4A2Q12974 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTP4A2Q12974 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTP4A2Q12974 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTP4A2Q12974 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTP4A2Q12974 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTP4A2Q12974 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTP4A2Q12974 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTP4A2Q12974 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTP4A2Q12974 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTP4A2Q12974 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTP4A2Q12974 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTP4A2Q12974 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTP4A2Q12974 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTP4A2Q12974 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTP4A2Q12974 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTP4A2Q12974 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTP4A2Q12974 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTP4A2Q12974 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTP4A2Q12974 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
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