Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPREP23469 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPREP23469 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPREP23469 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPREP23469 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPREP23469 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPREP23469 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPREP23469 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PTPREP23469 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPREP23469 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPREP23469 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPREP23469 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPREP23469 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPREP23469 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPREP23469 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PTPREP23469 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPREP23469 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPREP23469 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPREP23469 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPREP23469 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPREP23469 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPREP23469 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PTPREP23469 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPREP23469 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPREP23469 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPREP23469 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPREP23469 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPREP23469 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPREP23469 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PTPREP23469 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPREP23469 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPREP23469 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPREP23469 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPREP23469 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPREP23469 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPREP23469 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPREP23469 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPREP23469 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPREP23469 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPREP23469 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPREP23469 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPREP23469 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPREP23469 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPREP23469 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPREP23469 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPREP23469 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPREP23469 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPREP23469 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPREP23469 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPREP23469 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPREP23469 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPREP23469 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPREP23469 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPREP23469 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPREP23469 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPREP23469 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPREP23469 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPREP23469 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPREP23469 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPREP23469 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPREP23469 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPREP23469 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPREP23469 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPREP23469 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPREP23469 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPREP23469 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPREP23469 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPREP23469 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPREP23469 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPREP23469 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPREP23469 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPREP23469 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPREP23469 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPREP23469 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPREP23469 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPREP23469 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPREP23469 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPREP23469 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPREP23469 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPREP23469 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPREP23469 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPREP23469 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPREP23469 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPREP23469 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPREP23469 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPREP23469 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPREP23469 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPREP23469 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPREP23469 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPREP23469 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPREP23469 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPREP23469 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPREP23469 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPREP23469 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPREP23469 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPREP23469 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPREP23469 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPREP23469 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPREP23469 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPREP23469 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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