Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
EHD3Q9NZN3 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
EHD3Q9NZN3 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
EHD3Q9NZN3 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
EHD3Q9NZN3 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
EHD3Q9NZN3 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
EHD3Q9NZN3 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
EHD3Q9NZN3 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
EHD3Q9NZN3 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
EHD3Q9NZN3 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
EHD3Q9NZN3 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.21
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.21□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.17□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
EHD3Q9NZN3 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
EHD3Q9NZN3 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
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