Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
USP53Q70EK8 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
USP53Q70EK8 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
USP53Q70EK8 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
USP53Q70EK8 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
USP53Q70EK8 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
USP53Q70EK8 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
USP53Q70EK8 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
USP53Q70EK8 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
USP53Q70EK8 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
USP53Q70EK8 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
USP53Q70EK8 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
USP53Q70EK8 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
USP53Q70EK8 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
USP53Q70EK8 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
USP53Q70EK8 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
USP53Q70EK8 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
USP53Q70EK8 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
USP53Q70EK8 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
USP53Q70EK8 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
USP53Q70EK8 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
USP53Q70EK8 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
USP53Q70EK8 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
USP53Q70EK8 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
USP53Q70EK8 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
USP53Q70EK8 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
USP53Q70EK8 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
USP53Q70EK8 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
USP53Q70EK8 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
USP53Q70EK8 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
USP53Q70EK8 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
USP53Q70EK8 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
USP53Q70EK8 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
USP53Q70EK8 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
USP53Q70EK8 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
USP53Q70EK8 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
USP53Q70EK8 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
USP53Q70EK8 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
USP53Q70EK8 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
USP53Q70EK8 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
USP53Q70EK8 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
USP53Q70EK8 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
USP53Q70EK8 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
USP53Q70EK8 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
USP53Q70EK8 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
USP53Q70EK8 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
USP53Q70EK8 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
USP53Q70EK8 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
USP53Q70EK8 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
USP53Q70EK8 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
USP53Q70EK8 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
USP53Q70EK8 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
USP53Q70EK8 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
USP53Q70EK8 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
USP53Q70EK8 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.47□□□□□ -2.17
USP53Q70EK8 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
USP53Q70EK8 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
USP53Q70EK8 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
USP53Q70EK8 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
USP53Q70EK8 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
USP53Q70EK8 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
USP53Q70EK8 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
USP53Q70EK8 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
USP53Q70EK8 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
USP53Q70EK8 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
USP53Q70EK8 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
USP53Q70EK8 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
USP53Q70EK8 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
USP53Q70EK8 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
USP53Q70EK8 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
USP53Q70EK8 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
USP53Q70EK8 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
USP53Q70EK8 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
USP53Q70EK8 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
USP53Q70EK8 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
USP53Q70EK8 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
USP53Q70EK8 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
USP53Q70EK8 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
USP53Q70EK8 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
USP53Q70EK8 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
USP53Q70EK8 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
USP53Q70EK8 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
USP53Q70EK8 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
USP53Q70EK8 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
USP53Q70EK8 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
USP53Q70EK8 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
USP53Q70EK8 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
USP53Q70EK8 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
USP53Q70EK8 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
USP53Q70EK8 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
USP53Q70EK8 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
USP53Q70EK8 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
USP53Q70EK8 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
USP53Q70EK8 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
USP53Q70EK8 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
USP53Q70EK8 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
USP53Q70EK8 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
USP53Q70EK8 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
USP53Q70EK8 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
USP53Q70EK8 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
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