Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SKIDA1Q1XH10 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SKIDA1Q1XH10 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SKIDA1Q1XH10 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SKIDA1Q1XH10 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SKIDA1Q1XH10 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SKIDA1Q1XH10 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SKIDA1Q1XH10 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SKIDA1Q1XH10 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SKIDA1Q1XH10 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SKIDA1Q1XH10 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SKIDA1Q1XH10 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SKIDA1Q1XH10 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SKIDA1Q1XH10 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SKIDA1Q1XH10 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SKIDA1Q1XH10 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SKIDA1Q1XH10 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SKIDA1Q1XH10 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SKIDA1Q1XH10 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SKIDA1Q1XH10 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SKIDA1Q1XH10 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
SKIDA1Q1XH10 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SKIDA1Q1XH10 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SKIDA1Q1XH10 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SKIDA1Q1XH10 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SKIDA1Q1XH10 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SKIDA1Q1XH10 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SKIDA1Q1XH10 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SKIDA1Q1XH10 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SKIDA1Q1XH10 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SKIDA1Q1XH10 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SKIDA1Q1XH10 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SKIDA1Q1XH10 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SKIDA1Q1XH10 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SKIDA1Q1XH10 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SKIDA1Q1XH10 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SKIDA1Q1XH10 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SKIDA1Q1XH10 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SKIDA1Q1XH10 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SKIDA1Q1XH10 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SKIDA1Q1XH10 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SKIDA1Q1XH10 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SKIDA1Q1XH10 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
SKIDA1Q1XH10 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SKIDA1Q1XH10 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SKIDA1Q1XH10 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SKIDA1Q1XH10 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SKIDA1Q1XH10 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SKIDA1Q1XH10 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SKIDA1Q1XH10 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SKIDA1Q1XH10 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SKIDA1Q1XH10 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SKIDA1Q1XH10 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SKIDA1Q1XH10 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
SKIDA1Q1XH10 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
SKIDA1Q1XH10 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SKIDA1Q1XH10 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SKIDA1Q1XH10 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SKIDA1Q1XH10 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SKIDA1Q1XH10 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SKIDA1Q1XH10 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SKIDA1Q1XH10 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SKIDA1Q1XH10 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SKIDA1Q1XH10 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SKIDA1Q1XH10 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SKIDA1Q1XH10 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
SKIDA1Q1XH10 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SKIDA1Q1XH10 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SKIDA1Q1XH10 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SKIDA1Q1XH10 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SKIDA1Q1XH10 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SKIDA1Q1XH10 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
SKIDA1Q1XH10 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SKIDA1Q1XH10 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SKIDA1Q1XH10 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SKIDA1Q1XH10 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SKIDA1Q1XH10 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SKIDA1Q1XH10 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SKIDA1Q1XH10 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SKIDA1Q1XH10 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SKIDA1Q1XH10 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SKIDA1Q1XH10 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SKIDA1Q1XH10 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SKIDA1Q1XH10 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SKIDA1Q1XH10 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SKIDA1Q1XH10 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SKIDA1Q1XH10 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SKIDA1Q1XH10 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SKIDA1Q1XH10 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SKIDA1Q1XH10 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
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