Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ECM1Q16610 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ECM1Q16610 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ECM1Q16610 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ECM1Q16610 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ECM1Q16610 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ECM1Q16610 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ECM1Q16610 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ECM1Q16610 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ECM1Q16610 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ECM1Q16610 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ECM1Q16610 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ECM1Q16610 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ECM1Q16610 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ECM1Q16610 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ECM1Q16610 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ECM1Q16610 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ECM1Q16610 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ECM1Q16610 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ECM1Q16610 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ECM1Q16610 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ECM1Q16610 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
ECM1Q16610 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ECM1Q16610 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ECM1Q16610 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ECM1Q16610 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ECM1Q16610 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ECM1Q16610 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ECM1Q16610 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ECM1Q16610 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ECM1Q16610 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
ECM1Q16610 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ECM1Q16610 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ECM1Q16610 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ECM1Q16610 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ECM1Q16610 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ECM1Q16610 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ECM1Q16610 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ECM1Q16610 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ECM1Q16610 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ECM1Q16610 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ECM1Q16610 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ECM1Q16610 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ECM1Q16610 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ECM1Q16610 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
ECM1Q16610 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ECM1Q16610 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ECM1Q16610 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ECM1Q16610 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ECM1Q16610 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ECM1Q16610 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ECM1Q16610 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ECM1Q16610 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ECM1Q16610 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
ECM1Q16610 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ECM1Q16610 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ECM1Q16610 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ECM1Q16610 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ECM1Q16610 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ECM1Q16610 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ECM1Q16610 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ECM1Q16610 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ECM1Q16610 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ECM1Q16610 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ECM1Q16610 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ECM1Q16610 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ECM1Q16610 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ECM1Q16610 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ECM1Q16610 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ECM1Q16610 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ECM1Q16610 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ECM1Q16610 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
ECM1Q16610 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ECM1Q16610 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ECM1Q16610 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ECM1Q16610 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ECM1Q16610 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ECM1Q16610 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ECM1Q16610 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
ECM1Q16610 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
ECM1Q16610 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ECM1Q16610 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ECM1Q16610 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ECM1Q16610 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ECM1Q16610 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ECM1Q16610 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ECM1Q16610 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ECM1Q16610 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ECM1Q16610 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ECM1Q16610 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
ECM1Q16610 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ECM1Q16610 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ECM1Q16610 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ECM1Q16610 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ECM1Q16610 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ECM1Q16610 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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