Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SCN9AQ15858 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SCN9AQ15858 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SCN9AQ15858 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SCN9AQ15858 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
SCN9AQ15858 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
SCN9AQ15858 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SCN9AQ15858 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SCN9AQ15858 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SCN9AQ15858 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SCN9AQ15858 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SCN9AQ15858 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SCN9AQ15858 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SCN9AQ15858 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SCN9AQ15858 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SCN9AQ15858 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC-0.72□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC-0.75□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SCN9AQ15858 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SCN9AQ15858 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
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