Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRRQ15256 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRRQ15256 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRRQ15256 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRRQ15256 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRRQ15256 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
PTPRRQ15256 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRRQ15256 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRRQ15256 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRRQ15256 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRRQ15256 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRRQ15256 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRRQ15256 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRRQ15256 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRRQ15256 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRRQ15256 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRRQ15256 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTPRRQ15256 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRRQ15256 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRRQ15256 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRRQ15256 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRRQ15256 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRRQ15256 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.5 ms