Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
KARSQ15046 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
KARSQ15046 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
KARSQ15046 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
KARSQ15046 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
KARSQ15046 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
KARSQ15046 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
KARSQ15046 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
KARSQ15046 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
KARSQ15046 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
KARSQ15046 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
KARSQ15046 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
KARSQ15046 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
KARSQ15046 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
KARSQ15046 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
KARSQ15046 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
KARSQ15046 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
KARSQ15046 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
KARSQ15046 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
KARSQ15046 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
KARSQ15046 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
KARSQ15046 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
KARSQ15046 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
KARSQ15046 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
KARSQ15046 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC0□□□□□ -2.41
KARSQ15046 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC0□□□□□ -2.41
KARSQ15046 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC0□□□□□ -2.41
KARSQ15046 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC0□□□□□ -2.41
KARSQ15046 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC0□□□□□ -2.41
KARSQ15046 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC0□□□□□ -2.41
KARSQ15046 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC0□□□□□ -2.41
KARSQ15046 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0□□□□□ -2.41
KARSQ15046 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC0□□□□□ -2.41
KARSQ15046 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC0□□□□□ -2.41
KARSQ15046 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
KARSQ15046 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0□□□□□ -2.41
KARSQ15046 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC0□□□□□ -2.41
KARSQ15046 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0□□□□□ -2.41
KARSQ15046 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0□□□□□ -2.41
KARSQ15046 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
KARSQ15046 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
KARSQ15046 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
KARSQ15046 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
KARSQ15046 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
KARSQ15046 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
KARSQ15046 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
KARSQ15046 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
KARSQ15046 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
KARSQ15046 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
KARSQ15046 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
KARSQ15046 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
KARSQ15046 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
KARSQ15046 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
KARSQ15046 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
KARSQ15046 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
KARSQ15046 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
KARSQ15046 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
KARSQ15046 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
KARSQ15046 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
KARSQ15046 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC-0.02□□□□□ -2.41
KARSQ15046 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
KARSQ15046 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
KARSQ15046 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
KARSQ15046 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
KARSQ15046 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
KARSQ15046 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
KARSQ15046 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
KARSQ15046 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
KARSQ15046 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
KARSQ15046 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
KARSQ15046 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
KARSQ15046 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
KARSQ15046 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
KARSQ15046 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
KARSQ15046 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
KARSQ15046 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
KARSQ15046 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
KARSQ15046 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
KARSQ15046 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
KARSQ15046 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
KARSQ15046 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
KARSQ15046 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
KARSQ15046 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
KARSQ15046 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
KARSQ15046 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
KARSQ15046 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
KARSQ15046 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
KARSQ15046 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
KARSQ15046 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
KARSQ15046 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
KARSQ15046 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
KARSQ15046 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
KARSQ15046 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
KARSQ15046 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
KARSQ15046 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
KARSQ15046 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
KARSQ15046 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
KARSQ15046 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
KARSQ15046 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
KARSQ15046 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
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