Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
DDX39BQ13838 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
DDX39BQ13838 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
DDX39BQ13838 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
DDX39BQ13838 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
DDX39BQ13838 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
DDX39BQ13838 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
DDX39BQ13838 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
DDX39BQ13838 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
DDX39BQ13838 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
DDX39BQ13838 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
DDX39BQ13838 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
DDX39BQ13838 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
DDX39BQ13838 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
DDX39BQ13838 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
DDX39BQ13838 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
DDX39BQ13838 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
DDX39BQ13838 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
DDX39BQ13838 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
DDX39BQ13838 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
DDX39BQ13838 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
DDX39BQ13838 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
DDX39BQ13838 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
DDX39BQ13838 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
DDX39BQ13838 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
DDX39BQ13838 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
DDX39BQ13838 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
DDX39BQ13838 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
DDX39BQ13838 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
DDX39BQ13838 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
DDX39BQ13838 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
DDX39BQ13838 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
DDX39BQ13838 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
DDX39BQ13838 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
DDX39BQ13838 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
DDX39BQ13838 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
DDX39BQ13838 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
DDX39BQ13838 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
DDX39BQ13838 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
DDX39BQ13838 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
DDX39BQ13838 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC-0.61□□□□□ -2.51
DDX39BQ13838 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
DDX39BQ13838 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
DDX39BQ13838 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
DDX39BQ13838 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
DDX39BQ13838 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
DDX39BQ13838 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
DDX39BQ13838 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
DDX39BQ13838 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
DDX39BQ13838 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
DDX39BQ13838 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
DDX39BQ13838 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
DDX39BQ13838 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
DDX39BQ13838 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
DDX39BQ13838 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
DDX39BQ13838 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
DDX39BQ13838 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
DDX39BQ13838 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
DDX39BQ13838 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
DDX39BQ13838 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
DDX39BQ13838 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
DDX39BQ13838 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
DDX39BQ13838 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
DDX39BQ13838 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
DDX39BQ13838 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
DDX39BQ13838 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
DDX39BQ13838 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
DDX39BQ13838 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
DDX39BQ13838 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
DDX39BQ13838 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
DDX39BQ13838 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
DDX39BQ13838 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
DDX39BQ13838 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
DDX39BQ13838 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
DDX39BQ13838 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC-0.66□□□□□ -2.51
DDX39BQ13838 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
DDX39BQ13838 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
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