Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TRAF3Q13114 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TRAF3Q13114 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TRAF3Q13114 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TRAF3Q13114 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TRAF3Q13114 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TRAF3Q13114 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TRAF3Q13114 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TRAF3Q13114 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TRAF3Q13114 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TRAF3Q13114 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TRAF3Q13114 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
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TRAF3Q13114 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TRAF3Q13114 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TRAF3Q13114 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TRAF3Q13114 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TRAF3Q13114 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TRAF3Q13114 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TRAF3Q13114 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TRAF3Q13114 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TRAF3Q13114 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TRAF3Q13114 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TRAF3Q13114 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
TRAF3Q13114 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRAF3Q13114 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRAF3Q13114 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRAF3Q13114 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRAF3Q13114 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRAF3Q13114 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRAF3Q13114 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRAF3Q13114 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRAF3Q13114 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRAF3Q13114 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRAF3Q13114 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRAF3Q13114 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRAF3Q13114 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TRAF3Q13114 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TRAF3Q13114 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TRAF3Q13114 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
TRAF3Q13114 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TRAF3Q13114 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TRAF3Q13114 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TRAF3Q13114 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TRAF3Q13114 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TRAF3Q13114 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
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TRAF3Q13114 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TRAF3Q13114 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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TRAF3Q13114 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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TRAF3Q13114 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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TRAF3Q13114 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TRAF3Q13114 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRAF3Q13114 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRAF3Q13114 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRAF3Q13114 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRAF3Q13114 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRAF3Q13114 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRAF3Q13114 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRAF3Q13114 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRAF3Q13114 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRAF3Q13114 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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