Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GPS1Q13098 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GPS1Q13098 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GPS1Q13098 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GPS1Q13098 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GPS1Q13098 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GPS1Q13098 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GPS1Q13098 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GPS1Q13098 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GPS1Q13098 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GPS1Q13098 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GPS1Q13098 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GPS1Q13098 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GPS1Q13098 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GPS1Q13098 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GPS1Q13098 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GPS1Q13098 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GPS1Q13098 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GPS1Q13098 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GPS1Q13098 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
GPS1Q13098 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
GPS1Q13098 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
GPS1Q13098 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
GPS1Q13098 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
GPS1Q13098 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
GPS1Q13098 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC0.81□□□□□ -2.28
GPS1Q13098 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
GPS1Q13098 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GPS1Q13098 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GPS1Q13098 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GPS1Q13098 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GPS1Q13098 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GPS1Q13098 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GPS1Q13098 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GPS1Q13098 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GPS1Q13098 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GPS1Q13098 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GPS1Q13098 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GPS1Q13098 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
GPS1Q13098 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GPS1Q13098 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
GPS1Q13098 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
GPS1Q13098 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
GPS1Q13098 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
GPS1Q13098 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
GPS1Q13098 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
GPS1Q13098 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
GPS1Q13098 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
GPS1Q13098 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
GPS1Q13098 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
GPS1Q13098 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
GPS1Q13098 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
GPS1Q13098 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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GPS1Q13098 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
GPS1Q13098 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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