Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPREP23469 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPREP23469 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPREP23469 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPREP23469 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPREP23469 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPREP23469 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPREP23469 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPREP23469 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPREP23469 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPREP23469 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPREP23469 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPREP23469 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPREP23469 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPREP23469 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPREP23469 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPREP23469 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPREP23469 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPREP23469 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPREP23469 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPREP23469 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPREP23469 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPREP23469 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPREP23469 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPREP23469 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
PTPREP23469 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPREP23469 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPREP23469 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPREP23469 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPREP23469 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPREP23469 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPREP23469 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPREP23469 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPREP23469 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPREP23469 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPREP23469 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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PTPREP23469 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPREP23469 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPREP23469 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPREP23469 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPREP23469 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPREP23469 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPREP23469 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPREP23469 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPREP23469 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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PTPREP23469 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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PTPREP23469 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPREP23469 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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PTPREP23469 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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PTPREP23469 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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PTPREP23469 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPREP23469 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPREP23469 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPREP23469 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPREP23469 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPREP23469 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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PTPREP23469 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPREP23469 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPREP23469 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPREP23469 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPREP23469 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPREP23469 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPREP23469 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPREP23469 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPREP23469 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPREP23469 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPREP23469 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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PTPREP23469 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPREP23469 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPREP23469 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPREP23469 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPREP23469 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPREP23469 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPREP23469 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPREP23469 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPREP23469 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPREP23469 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPREP23469 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPREP23469 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPREP23469 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
PTPREP23469 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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