Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
UBQLN4Q9NRR5 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
UBQLN4Q9NRR5 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
UBQLN4Q9NRR5 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
UBQLN4Q9NRR5 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
UBQLN4Q9NRR5 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
UBQLN4Q9NRR5 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
UBQLN4Q9NRR5 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
UBQLN4Q9NRR5 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
UBQLN4Q9NRR5 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
UBQLN4Q9NRR5 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
UBQLN4Q9NRR5 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
UBQLN4Q9NRR5 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
UBQLN4Q9NRR5 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 218.3 ms