Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRN9

TM2D3, TM2 domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D3Q9BRN9 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.08□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.08□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
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TM2D3Q9BRN9 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
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TM2D3Q9BRN9 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC0.04□□□□□ -2.4
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TM2D3Q9BRN9 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
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TM2D3Q9BRN9 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
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TM2D3Q9BRN9 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
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TM2D3Q9BRN9 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TM2D3Q9BRN9 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TM2D3Q9BRN9 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TM2D3Q9BRN9 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TM2D3Q9BRN9 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TM2D3Q9BRN9 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TM2D3Q9BRN9 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TM2D3Q9BRN9 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TM2D3Q9BRN9 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TM2D3Q9BRN9 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TM2D3Q9BRN9 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
TM2D3Q9BRN9 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TM2D3Q9BRN9 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TM2D3Q9BRN9 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
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