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Protein–RNA interactions for Protein: Q717R9
CYS1, Cystin-1, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
CYS1
Q717R9
RNU6-923P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.41
CYS1
Q717R9
RNU6-302P-201
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107 nt
BASIC
-0.01
□□□□□ -2.41
CYS1
Q717R9
Y_RNA.393-201
ENST00000383936
102 nt
BASIC
-0.01
□□□□□ -2.41
CYS1
Q717R9
Y_RNA.435-201
ENST00000384095
112 nt
BASIC
-0.01
□□□□□ -2.41
CYS1
Q717R9
Y_RNA.470-201
ENST00000384307
117 nt
BASIC
-0.01
□□□□□ -2.41
CYS1
Q717R9
RNY1P4-201
ENST00000384595
115 nt
BASIC
-0.01
□□□□□ -2.41
CYS1
Q717R9
MIR1302-3-201
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138 nt
BASIC
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□□□□□ -2.41
CYS1
Q717R9
RNU7-129P-201
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62 nt
BASIC
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□□□□□ -2.41
CYS1
Q717R9
RNA5SP236-201
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116 nt
BASIC
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□□□□□ -2.41
CYS1
Q717R9
RNU4-71P-201
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113 nt
BASIC
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□□□□□ -2.41
CYS1
Q717R9
RNU6-1232P-201
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86 nt
BASIC
-0.01
□□□□□ -2.41
CYS1
Q717R9
RNU6-531P-201
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104 nt
BASIC
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□□□□□ -2.41
CYS1
Q717R9
MIR4305-201
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102 nt
BASIC
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□□□□□ -2.41
CYS1
Q717R9
Y_RNA.52-201
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BASIC
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□□□□□ -2.41
CYS1
Q717R9
RNA5SP133-201
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119 nt
BASIC
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□□□□□ -2.41
CYS1
Q717R9
Y_RNA.357-201
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109 nt
BASIC
-0.02
□□□□□ -2.41
CYS1
Q717R9
Y_RNA.531-201
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121 nt
BASIC
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□□□□□ -2.41
CYS1
Q717R9
MIR613-201
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95 nt
BASIC
-0.02
□□□□□ -2.41
CYS1
Q717R9
MIR643-201
ENST00000385267
97 nt
BASIC
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□□□□□ -2.41
CYS1
Q717R9
TRAJ1-201
ENST00000390536
62 nt
APPRIS P1
BASIC
-0.02
□□□□□ -2.41
CYS1
Q717R9
Y_RNA.660-201
ENST00000516002
120 nt
BASIC
-0.02
□□□□□ -2.41
CYS1
Q717R9
Y_RNA.668-201
ENST00000516233
93 nt
BASIC
-0.02
□□□□□ -2.41
CYS1
Q717R9
AC141557.1-201
ENST00000540982
400 nt
BASIC
-0.02
□□□□□ -2.41
CYS1
Q717R9
MIR4667-201
ENST00000578933
66 nt
BASIC
-0.02
□□□□□ -2.41
CYS1
Q717R9
MIR4743-201
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69 nt
BASIC
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□□□□□ -2.41
CYS1
Q717R9
U6.106-201
ENST00000636360
105 nt
BASIC
-0.02
□□□□□ -2.41
CYS1
Q717R9
MIR101-2-201
ENST00000362195
79 nt
BASIC
-0.03
□□□□□ -2.41
CYS1
Q717R9
SNORD27-201
ENST00000363981
72 nt
BASIC
-0.03
□□□□□ -2.41
CYS1
Q717R9
RNA5SP245-201
ENST00000364239
121 nt
BASIC
-0.03
□□□□□ -2.41
CYS1
Q717R9
Y_RNA.350-201
ENST00000365409
98 nt
BASIC
-0.03
□□□□□ -2.41
CYS1
Q717R9
SNORA2A-201
ENST00000383885
135 nt
BASIC
-0.03
□□□□□ -2.41
CYS1
Q717R9
RNU6-127P-201
ENST00000390897
107 nt
BASIC
-0.03
□□□□□ -2.41
CYS1
Q717R9
MTCYBP9-201
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303 nt
BASIC
-0.03
□□□□□ -2.41
CYS1
Q717R9
MTATP6P21-201
ENST00000440681
189 nt
BASIC
-0.03
□□□□□ -2.41
CYS1
Q717R9
AC244505.6-201
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130 nt
BASIC
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□□□□□ -2.41
CYS1
Q717R9
AC097716.1-201
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TSL 2
BASIC
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□□□□□ -2.41
CYS1
Q717R9
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115 nt
BASIC
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□□□□□ -2.41
CYS1
Q717R9
EBAG9-207
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777 nt
TSL 1 (best)
BASIC
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□□□□□ -2.41
CYS1
Q717R9
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296 nt
BASIC
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□□□□□ -2.41
CYS1
Q717R9
AC098479.1-201
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154 nt
BASIC
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□□□□□ -2.41
CYS1
Q717R9
RNY1-201
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CYS1
Q717R9
RNU6-312P-201
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BASIC
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CYS1
Q717R9
RNU6-716P-201
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103 nt
BASIC
-0.04
□□□□□ -2.42
CYS1
Q717R9
Y_RNA.412-201
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104 nt
BASIC
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□□□□□ -2.42
CYS1
Q717R9
MIR610-201
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BASIC
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□□□□□ -2.42
CYS1
Q717R9
RNU7-137P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.42
CYS1
Q717R9
AC138869.1-201
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BASIC
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CYS1
Q717R9
MIR4290-201
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95 nt
BASIC
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CYS1
Q717R9
RNU1-29P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.42
CYS1
Q717R9
CLRN1-AS1.1-201
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BASIC
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□□□□□ -2.42
CYS1
Q717R9
MIR6718-201
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BASIC
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CYS1
Q717R9
MIR411-201
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BASIC
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□□□□□ -2.42
CYS1
Q717R9
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BASIC
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□□□□□ -2.42
CYS1
Q717R9
Y_RNA.119-201
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BASIC
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□□□□□ -2.42
CYS1
Q717R9
Y_RNA.133-201
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110 nt
BASIC
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□□□□□ -2.42
CYS1
Q717R9
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BASIC
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□□□□□ -2.42
CYS1
Q717R9
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CYS1
Q717R9
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BASIC
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CYS1
Q717R9
RNU6-918P-201
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BASIC
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CYS1
Q717R9
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BASIC
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□□□□□ -2.42
CYS1
Q717R9
AC108059.2-201
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BASIC
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CYS1
Q717R9
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BASIC
-0.05
□□□□□ -2.42
CYS1
Q717R9
FAM13A-AS1_1.1-201
ENST00000612555
119 nt
BASIC
-0.05
□□□□□ -2.42
CYS1
Q717R9
MIR499B-201
ENST00000636498
73 nt
BASIC
-0.05
□□□□□ -2.42
CYS1
Q717R9
U6.109-201
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BASIC
-0.05
□□□□□ -2.42
CYS1
Q717R9
Y_RNA.118-201
ENST00000363300
101 nt
BASIC
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□□□□□ -2.42
CYS1
Q717R9
SNORD114-26-201
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BASIC
-0.06
□□□□□ -2.42
CYS1
Q717R9
RNY1P2-201
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117 nt
BASIC
-0.06
□□□□□ -2.42
CYS1
Q717R9
Y_RNA.299-201
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94 nt
BASIC
-0.06
□□□□□ -2.42
CYS1
Q717R9
RNU6-690P-201
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BASIC
-0.06
□□□□□ -2.42
CYS1
Q717R9
Y_RNA.337-201
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102 nt
BASIC
-0.06
□□□□□ -2.42
CYS1
Q717R9
Y_RNA.366-201
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102 nt
BASIC
-0.06
□□□□□ -2.42
CYS1
Q717R9
MIR593-201
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100 nt
BASIC
-0.06
□□□□□ -2.42
CYS1
Q717R9
MIR760-201
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BASIC
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□□□□□ -2.42
CYS1
Q717R9
MIR892B-201
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77 nt
BASIC
-0.06
□□□□□ -2.42
CYS1
Q717R9
Y_RNA.673-201
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88 nt
BASIC
-0.06
□□□□□ -2.42
CYS1
Q717R9
MIR1273G-201
ENST00000577677
100 nt
BASIC
-0.06
□□□□□ -2.42
CYS1
Q717R9
MIR548H5-201
ENST00000580314
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BASIC
-0.06
□□□□□ -2.42
CYS1
Q717R9
MIR3149-201
ENST00000584629
83 nt
BASIC
-0.06
□□□□□ -2.42
CYS1
Q717R9
RNU7-10P-201
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BASIC
-0.06
□□□□□ -2.42
CYS1
Q717R9
AC062037.2-201
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73 nt
BASIC
-0.06
□□□□□ -2.42
CYS1
Q717R9
Y_RNA.49-201
ENST00000362714
112 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
CYS1
Q717R9
SNORA63.5-201
ENST00000363548
123 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
CYS1
Q717R9
RNA5SP325-201
ENST00000363756
130 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
CYS1
Q717R9
RNU6-726P-201
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BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
CYS1
Q717R9
RNU6-818P-201
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BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
CYS1
Q717R9
SNORA32-201
ENST00000384072
121 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
CYS1
Q717R9
RNU6-768P-201
ENST00000384683
107 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
CYS1
Q717R9
TRAJ54-201
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APPRIS P1
BASIC
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□□□□□ -2.42
CYS1
Q717R9
RNU6-1023P-201
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106 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
CYS1
Q717R9
SNORD67.1-201
ENST00000516618
108 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
CYS1
Q717R9
RNU6-782P-201
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BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
CYS1
Q717R9
IGHVII-40-1-201
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BASIC
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□□□□□ -2.42
CYS1
Q717R9
MIR5706-201
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80 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
CYS1
Q717R9
MIR548AE2-201
ENST00000583456
67 nt
BASIC
-0.07
□□□□□ -2.42
CYS1
Q717R9
SNORD115-24-201
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BASIC
-0.08
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CYS1
Q717R9
RNU6-1082P-201
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107 nt
BASIC
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□□□□□ -2.42
CYS1
Q717R9
RNU6-702P-201
ENST00000364982
107 nt
BASIC
-0.08
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CYS1
Q717R9
RNU6-1336P-201
ENST00000383886
109 nt
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
CYS1
Q717R9
MIR568-201
ENST00000385036
95 nt
BASIC
-0.08
□□□□□ -2.42
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