Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SCN9AQ15858 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SCN9AQ15858 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SCN9AQ15858 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SCN9AQ15858 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SCN9AQ15858 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SCN9AQ15858 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SCN9AQ15858 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SCN9AQ15858 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SCN9AQ15858 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SCN9AQ15858 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SCN9AQ15858 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SCN9AQ15858 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SCN9AQ15858 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SCN9AQ15858 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SCN9AQ15858 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SCN9AQ15858 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SCN9AQ15858 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SCN9AQ15858 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SCN9AQ15858 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SCN9AQ15858 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SCN9AQ15858 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SCN9AQ15858 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
SCN9AQ15858 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SCN9AQ15858 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SCN9AQ15858 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SCN9AQ15858 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SCN9AQ15858 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SCN9AQ15858 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SCN9AQ15858 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SCN9AQ15858 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SCN9AQ15858 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SCN9AQ15858 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SCN9AQ15858 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SCN9AQ15858 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SCN9AQ15858 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SCN9AQ15858 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SCN9AQ15858 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SCN9AQ15858 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SCN9AQ15858 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SCN9AQ15858 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SCN9AQ15858 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SCN9AQ15858 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SCN9AQ15858 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
SCN9AQ15858 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
SCN9AQ15858 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
SCN9AQ15858 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SCN9AQ15858 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SCN9AQ15858 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SCN9AQ15858 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SCN9AQ15858 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SCN9AQ15858 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SCN9AQ15858 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SCN9AQ15858 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SCN9AQ15858 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SCN9AQ15858 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SCN9AQ15858 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
SCN9AQ15858 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SCN9AQ15858 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SCN9AQ15858 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SCN9AQ15858 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SCN9AQ15858 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
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SCN9AQ15858 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SCN9AQ15858 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SCN9AQ15858 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SCN9AQ15858 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SCN9AQ15858 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SCN9AQ15858 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SCN9AQ15858 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SCN9AQ15858 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SCN9AQ15858 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SCN9AQ15858 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SCN9AQ15858 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SCN9AQ15858 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SCN9AQ15858 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SCN9AQ15858 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SCN9AQ15858 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SCN9AQ15858 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SCN9AQ15858 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SCN9AQ15858 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SCN9AQ15858 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SCN9AQ15858 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
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SCN9AQ15858 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
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SCN9AQ15858 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
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SCN9AQ15858 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SCN9AQ15858 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SCN9AQ15858 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SCN9AQ15858 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SCN9AQ15858 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SCN9AQ15858 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SCN9AQ15858 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
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SCN9AQ15858 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SCN9AQ15858 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SCN9AQ15858 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
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