Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
HMGN3Q15651 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
HMGN3Q15651 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
HMGN3Q15651 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
HMGN3Q15651 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
HMGN3Q15651 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
HMGN3Q15651 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
HMGN3Q15651 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC-2.86□□□□□ -2.87
HMGN3Q15651 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
HMGN3Q15651 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
HMGN3Q15651 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
HMGN3Q15651 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
HMGN3Q15651 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
HMGN3Q15651 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
HMGN3Q15651 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
HMGN3Q15651 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
HMGN3Q15651 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
HMGN3Q15651 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
HMGN3Q15651 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
HMGN3Q15651 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
HMGN3Q15651 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
HMGN3Q15651 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
HMGN3Q15651 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
HMGN3Q15651 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
HMGN3Q15651 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC-2.88□□□□□ -2.87
HMGN3Q15651 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
HMGN3Q15651 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
HMGN3Q15651 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
HMGN3Q15651 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
HMGN3Q15651 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
HMGN3Q15651 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
HMGN3Q15651 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
HMGN3Q15651 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
HMGN3Q15651 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
HMGN3Q15651 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
HMGN3Q15651 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
HMGN3Q15651 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
HMGN3Q15651 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
HMGN3Q15651 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
HMGN3Q15651 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
HMGN3Q15651 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
HMGN3Q15651 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
HMGN3Q15651 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
HMGN3Q15651 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
HMGN3Q15651 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
HMGN3Q15651 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
HMGN3Q15651 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
HMGN3Q15651 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
HMGN3Q15651 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
HMGN3Q15651 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
HMGN3Q15651 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
HMGN3Q15651 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
HMGN3Q15651 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
HMGN3Q15651 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
HMGN3Q15651 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
HMGN3Q15651 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
HMGN3Q15651 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
HMGN3Q15651 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
HMGN3Q15651 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
HMGN3Q15651 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
HMGN3Q15651 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
HMGN3Q15651 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
HMGN3Q15651 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
HMGN3Q15651 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
HMGN3Q15651 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
HMGN3Q15651 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
HMGN3Q15651 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
HMGN3Q15651 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
HMGN3Q15651 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
HMGN3Q15651 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
HMGN3Q15651 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
HMGN3Q15651 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
HMGN3Q15651 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
HMGN3Q15651 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
HMGN3Q15651 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
HMGN3Q15651 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
HMGN3Q15651 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
HMGN3Q15651 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
HMGN3Q15651 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
HMGN3Q15651 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
HMGN3Q15651 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC-2.94□□□□□ -2.88
HMGN3Q15651 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC-2.94□□□□□ -2.88
HMGN3Q15651 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
HMGN3Q15651 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
HMGN3Q15651 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
HMGN3Q15651 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
HMGN3Q15651 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
HMGN3Q15651 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
HMGN3Q15651 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
HMGN3Q15651 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
HMGN3Q15651 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
HMGN3Q15651 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
HMGN3Q15651 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
HMGN3Q15651 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
HMGN3Q15651 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
HMGN3Q15651 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
HMGN3Q15651 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
HMGN3Q15651 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
HMGN3Q15651 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
HMGN3Q15651 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
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