Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
TRAM1Q15629 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
TRAM1Q15629 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
TRAM1Q15629 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
TRAM1Q15629 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC-0.95□□□□□ -2.56
TRAM1Q15629 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
TRAM1Q15629 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
TRAM1Q15629 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.95□□□□□ -2.56
TRAM1Q15629 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
TRAM1Q15629 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
TRAM1Q15629 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
TRAM1Q15629 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
TRAM1Q15629 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
TRAM1Q15629 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
TRAM1Q15629 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
TRAM1Q15629 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC-0.96□□□□□ -2.56
TRAM1Q15629 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
TRAM1Q15629 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
TRAM1Q15629 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
TRAM1Q15629 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
TRAM1Q15629 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
TRAM1Q15629 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
TRAM1Q15629 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
TRAM1Q15629 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
TRAM1Q15629 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
TRAM1Q15629 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
TRAM1Q15629 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
TRAM1Q15629 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
TRAM1Q15629 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
TRAM1Q15629 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
TRAM1Q15629 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
TRAM1Q15629 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC-0.98□□□□□ -2.57
TRAM1Q15629 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
TRAM1Q15629 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
TRAM1Q15629 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
TRAM1Q15629 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
TRAM1Q15629 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
TRAM1Q15629 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
TRAM1Q15629 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
TRAM1Q15629 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
TRAM1Q15629 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC-0.99□□□□□ -2.57
TRAM1Q15629 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC-0.99□□□□□ -2.57
TRAM1Q15629 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
TRAM1Q15629 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
TRAM1Q15629 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
TRAM1Q15629 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC-0.99□□□□□ -2.57
TRAM1Q15629 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
TRAM1Q15629 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
TRAM1Q15629 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
TRAM1Q15629 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
TRAM1Q15629 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1□□□□□ -2.57
TRAM1Q15629 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
TRAM1Q15629 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
TRAM1Q15629 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
TRAM1Q15629 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
TRAM1Q15629 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
TRAM1Q15629 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
TRAM1Q15629 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
TRAM1Q15629 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
TRAM1Q15629 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
TRAM1Q15629 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
TRAM1Q15629 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
TRAM1Q15629 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
TRAM1Q15629 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC-1.02□□□□□ -2.57
TRAM1Q15629 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
TRAM1Q15629 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
TRAM1Q15629 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
TRAM1Q15629 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
TRAM1Q15629 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
TRAM1Q15629 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
TRAM1Q15629 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
TRAM1Q15629 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
TRAM1Q15629 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
TRAM1Q15629 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC-1.04□□□□□ -2.58
TRAM1Q15629 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
TRAM1Q15629 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
TRAM1Q15629 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
TRAM1Q15629 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
TRAM1Q15629 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
TRAM1Q15629 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
TRAM1Q15629 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
TRAM1Q15629 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
TRAM1Q15629 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
TRAM1Q15629 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
TRAM1Q15629 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TRAM1Q15629 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TRAM1Q15629 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TRAM1Q15629 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TRAM1Q15629 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
TRAM1Q15629 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
TRAM1Q15629 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
TRAM1Q15629 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
TRAM1Q15629 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
TRAM1Q15629 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
TRAM1Q15629 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
TRAM1Q15629 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
TRAM1Q15629 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
TRAM1Q15629 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
TRAM1Q15629 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
TRAM1Q15629 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
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