Protein–RNA interactions for Protein: Q13546

RIPK1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK1Q13546 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.1□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC-0.11□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 244 ms