Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TRAF3Q13114 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TRAF3Q13114 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.04□□□□□ -2.24
TRAF3Q13114 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TRAF3Q13114 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TRAF3Q13114 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
TRAF3Q13114 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
TRAF3Q13114 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TRAF3Q13114 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
TRAF3Q13114 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
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TRAF3Q13114 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TRAF3Q13114 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TRAF3Q13114 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TRAF3Q13114 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TRAF3Q13114 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TRAF3Q13114 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TRAF3Q13114 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TRAF3Q13114 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TRAF3Q13114 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TRAF3Q13114 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TRAF3Q13114 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TRAF3Q13114 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TRAF3Q13114 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TRAF3Q13114 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TRAF3Q13114 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TRAF3Q13114 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TRAF3Q13114 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TRAF3Q13114 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TRAF3Q13114 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TRAF3Q13114 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TRAF3Q13114 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TRAF3Q13114 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.25
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TRAF3Q13114 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
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TRAF3Q13114 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TRAF3Q13114 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TRAF3Q13114 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TRAF3Q13114 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TRAF3Q13114 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TRAF3Q13114 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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TRAF3Q13114 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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TRAF3Q13114 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TRAF3Q13114 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TRAF3Q13114 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TRAF3Q13114 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TRAF3Q13114 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TRAF3Q13114 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TRAF3Q13114 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TRAF3Q13114 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
TRAF3Q13114 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
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