Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RAB40BQ12829 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RAB40BQ12829 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RAB40BQ12829 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RAB40BQ12829 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RAB40BQ12829 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RAB40BQ12829 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RAB40BQ12829 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RAB40BQ12829 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RAB40BQ12829 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RAB40BQ12829 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RAB40BQ12829 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RAB40BQ12829 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RAB40BQ12829 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RAB40BQ12829 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RAB40BQ12829 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RAB40BQ12829 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
RAB40BQ12829 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RAB40BQ12829 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RAB40BQ12829 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RAB40BQ12829 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RAB40BQ12829 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RAB40BQ12829 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RAB40BQ12829 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RAB40BQ12829 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RAB40BQ12829 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RAB40BQ12829 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RAB40BQ12829 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RAB40BQ12829 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RAB40BQ12829 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RAB40BQ12829 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RAB40BQ12829 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RAB40BQ12829 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RAB40BQ12829 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RAB40BQ12829 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RAB40BQ12829 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RAB40BQ12829 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RAB40BQ12829 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RAB40BQ12829 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RAB40BQ12829 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RAB40BQ12829 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RAB40BQ12829 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RAB40BQ12829 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
RAB40BQ12829 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RAB40BQ12829 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RAB40BQ12829 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.08□□□□□ -2.42
RAB40BQ12829 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
RAB40BQ12829 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
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RAB40BQ12829 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
RAB40BQ12829 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
RAB40BQ12829 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
RAB40BQ12829 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
RAB40BQ12829 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
RAB40BQ12829 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
RAB40BQ12829 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
RAB40BQ12829 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
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RAB40BQ12829 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
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RAB40BQ12829 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
RAB40BQ12829 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
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RAB40BQ12829 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
RAB40BQ12829 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
RAB40BQ12829 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
RAB40BQ12829 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
RAB40BQ12829 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
RAB40BQ12829 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
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RAB40BQ12829 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
RAB40BQ12829 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
RAB40BQ12829 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
RAB40BQ12829 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
RAB40BQ12829 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
RAB40BQ12829 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
RAB40BQ12829 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
RAB40BQ12829 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
RAB40BQ12829 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RAB40BQ12829 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RAB40BQ12829 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RAB40BQ12829 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RAB40BQ12829 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RAB40BQ12829 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RAB40BQ12829 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RAB40BQ12829 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
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