Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RABGEF1Q9UJ41 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RABGEF1Q9UJ41 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RABGEF1Q9UJ41 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RABGEF1Q9UJ41 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RABGEF1Q9UJ41 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RABGEF1Q9UJ41 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RABGEF1Q9UJ41 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RABGEF1Q9UJ41 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
RABGEF1Q9UJ41 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RABGEF1Q9UJ41 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RABGEF1Q9UJ41 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RABGEF1Q9UJ41 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RABGEF1Q9UJ41 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RABGEF1Q9UJ41 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RABGEF1Q9UJ41 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RABGEF1Q9UJ41 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RABGEF1Q9UJ41 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RABGEF1Q9UJ41 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RABGEF1Q9UJ41 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RABGEF1Q9UJ41 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RABGEF1Q9UJ41 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RABGEF1Q9UJ41 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RABGEF1Q9UJ41 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RABGEF1Q9UJ41 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RABGEF1Q9UJ41 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RABGEF1Q9UJ41 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RABGEF1Q9UJ41 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RABGEF1Q9UJ41 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RABGEF1Q9UJ41 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RABGEF1Q9UJ41 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RABGEF1Q9UJ41 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RABGEF1Q9UJ41 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RABGEF1Q9UJ41 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
RABGEF1Q9UJ41 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RABGEF1Q9UJ41 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RABGEF1Q9UJ41 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RABGEF1Q9UJ41 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RABGEF1Q9UJ41 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RABGEF1Q9UJ41 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RABGEF1Q9UJ41 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RABGEF1Q9UJ41 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RABGEF1Q9UJ41 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RABGEF1Q9UJ41 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RABGEF1Q9UJ41 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RABGEF1Q9UJ41 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
RABGEF1Q9UJ41 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RABGEF1Q9UJ41 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RABGEF1Q9UJ41 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RABGEF1Q9UJ41 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RABGEF1Q9UJ41 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RABGEF1Q9UJ41 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RABGEF1Q9UJ41 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RABGEF1Q9UJ41 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RABGEF1Q9UJ41 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RABGEF1Q9UJ41 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RABGEF1Q9UJ41 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RABGEF1Q9UJ41 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RABGEF1Q9UJ41 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RABGEF1Q9UJ41 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RABGEF1Q9UJ41 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RABGEF1Q9UJ41 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RABGEF1Q9UJ41 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RABGEF1Q9UJ41 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RABGEF1Q9UJ41 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RABGEF1Q9UJ41 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RABGEF1Q9UJ41 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RABGEF1Q9UJ41 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RABGEF1Q9UJ41 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RABGEF1Q9UJ41 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
RABGEF1Q9UJ41 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RABGEF1Q9UJ41 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RABGEF1Q9UJ41 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RABGEF1Q9UJ41 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RABGEF1Q9UJ41 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RABGEF1Q9UJ41 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RABGEF1Q9UJ41 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RABGEF1Q9UJ41 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RABGEF1Q9UJ41 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RABGEF1Q9UJ41 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
RABGEF1Q9UJ41 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
RABGEF1Q9UJ41 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RABGEF1Q9UJ41 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RABGEF1Q9UJ41 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RABGEF1Q9UJ41 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RABGEF1Q9UJ41 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RABGEF1Q9UJ41 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.7 ms