Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
USP35Q9P2H5 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
USP35Q9P2H5 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP35Q9P2H5 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP35Q9P2H5 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP35Q9P2H5 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP35Q9P2H5 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP35Q9P2H5 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP35Q9P2H5 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP35Q9P2H5 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP35Q9P2H5 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP35Q9P2H5 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP35Q9P2H5 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP35Q9P2H5 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP35Q9P2H5 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
USP35Q9P2H5 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP35Q9P2H5 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP35Q9P2H5 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
USP35Q9P2H5 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
USP35Q9P2H5 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
USP35Q9P2H5 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
USP35Q9P2H5 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USP35Q9P2H5 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USP35Q9P2H5 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USP35Q9P2H5 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USP35Q9P2H5 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USP35Q9P2H5 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USP35Q9P2H5 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USP35Q9P2H5 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USP35Q9P2H5 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
USP35Q9P2H5 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP35Q9P2H5 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP35Q9P2H5 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP35Q9P2H5 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP35Q9P2H5 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP35Q9P2H5 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP35Q9P2H5 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP35Q9P2H5 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
USP35Q9P2H5 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USP35Q9P2H5 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USP35Q9P2H5 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USP35Q9P2H5 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USP35Q9P2H5 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USP35Q9P2H5 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USP35Q9P2H5 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USP35Q9P2H5 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USP35Q9P2H5 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USP35Q9P2H5 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USP35Q9P2H5 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USP35Q9P2H5 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USP35Q9P2H5 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
USP35Q9P2H5 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
USP35Q9P2H5 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
USP35Q9P2H5 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
USP35Q9P2H5 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
USP35Q9P2H5 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
USP35Q9P2H5 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
USP35Q9P2H5 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
USP35Q9P2H5 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
USP35Q9P2H5 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
USP35Q9P2H5 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
USP35Q9P2H5 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
USP35Q9P2H5 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
USP35Q9P2H5 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
USP35Q9P2H5 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
USP35Q9P2H5 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
USP35Q9P2H5 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
USP35Q9P2H5 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
USP35Q9P2H5 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
USP35Q9P2H5 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
USP35Q9P2H5 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
USP35Q9P2H5 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
USP35Q9P2H5 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
USP35Q9P2H5 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
USP35Q9P2H5 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
USP35Q9P2H5 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
USP35Q9P2H5 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
USP35Q9P2H5 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
USP35Q9P2H5 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
USP35Q9P2H5 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
USP35Q9P2H5 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
USP35Q9P2H5 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
USP35Q9P2H5 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
USP35Q9P2H5 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
USP35Q9P2H5 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
USP35Q9P2H5 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
USP35Q9P2H5 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
USP35Q9P2H5 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
USP35Q9P2H5 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
USP35Q9P2H5 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
USP35Q9P2H5 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
USP35Q9P2H5 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
USP35Q9P2H5 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
USP35Q9P2H5 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
USP35Q9P2H5 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
USP35Q9P2H5 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
USP35Q9P2H5 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
USP35Q9P2H5 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
USP35Q9P2H5 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
USP35Q9P2H5 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
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