Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TPRNQ4KMQ1 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TPRNQ4KMQ1 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TPRNQ4KMQ1 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TPRNQ4KMQ1 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TPRNQ4KMQ1 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TPRNQ4KMQ1 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TPRNQ4KMQ1 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TPRNQ4KMQ1 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TPRNQ4KMQ1 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TPRNQ4KMQ1 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TPRNQ4KMQ1 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TPRNQ4KMQ1 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TPRNQ4KMQ1 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TPRNQ4KMQ1 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TPRNQ4KMQ1 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TPRNQ4KMQ1 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TPRNQ4KMQ1 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TPRNQ4KMQ1 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TPRNQ4KMQ1 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TPRNQ4KMQ1 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TPRNQ4KMQ1 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TPRNQ4KMQ1 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TPRNQ4KMQ1 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TPRNQ4KMQ1 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TPRNQ4KMQ1 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TPRNQ4KMQ1 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TPRNQ4KMQ1 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TPRNQ4KMQ1 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
TPRNQ4KMQ1 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TPRNQ4KMQ1 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TPRNQ4KMQ1 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TPRNQ4KMQ1 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TPRNQ4KMQ1 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TPRNQ4KMQ1 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TPRNQ4KMQ1 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TPRNQ4KMQ1 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TPRNQ4KMQ1 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TPRNQ4KMQ1 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TPRNQ4KMQ1 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TPRNQ4KMQ1 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TPRNQ4KMQ1 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TPRNQ4KMQ1 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TPRNQ4KMQ1 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TPRNQ4KMQ1 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TPRNQ4KMQ1 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TPRNQ4KMQ1 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TPRNQ4KMQ1 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TPRNQ4KMQ1 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TPRNQ4KMQ1 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TPRNQ4KMQ1 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TPRNQ4KMQ1 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TPRNQ4KMQ1 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TPRNQ4KMQ1 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TPRNQ4KMQ1 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TPRNQ4KMQ1 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TPRNQ4KMQ1 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TPRNQ4KMQ1 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TPRNQ4KMQ1 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TPRNQ4KMQ1 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TPRNQ4KMQ1 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TPRNQ4KMQ1 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TPRNQ4KMQ1 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TPRNQ4KMQ1 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TPRNQ4KMQ1 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TPRNQ4KMQ1 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TPRNQ4KMQ1 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TPRNQ4KMQ1 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TPRNQ4KMQ1 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TPRNQ4KMQ1 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TPRNQ4KMQ1 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TPRNQ4KMQ1 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TPRNQ4KMQ1 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TPRNQ4KMQ1 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
TPRNQ4KMQ1 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
TPRNQ4KMQ1 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TPRNQ4KMQ1 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TPRNQ4KMQ1 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TPRNQ4KMQ1 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TPRNQ4KMQ1 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
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