Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
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SCN9AQ15858 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
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SCN9AQ15858 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
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SCN9AQ15858 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
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SCN9AQ15858 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
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SCN9AQ15858 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
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SCN9AQ15858 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SCN9AQ15858 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SCN9AQ15858 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SCN9AQ15858 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SCN9AQ15858 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SCN9AQ15858 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SCN9AQ15858 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SCN9AQ15858 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SCN9AQ15858 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SCN9AQ15858 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC-0.61□□□□□ -2.51
SCN9AQ15858 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SCN9AQ15858 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SCN9AQ15858 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SCN9AQ15858 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SCN9AQ15858 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SCN9AQ15858 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
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SCN9AQ15858 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SCN9AQ15858 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
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