Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SEC23BQ15437 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
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SEC23BQ15437 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SEC23BQ15437 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
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SEC23BQ15437 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
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SEC23BQ15437 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
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SEC23BQ15437 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
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SEC23BQ15437 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SEC23BQ15437 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SEC23BQ15437 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SEC23BQ15437 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SEC23BQ15437 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SEC23BQ15437 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SEC23BQ15437 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
SEC23BQ15437 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SEC23BQ15437 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SEC23BQ15437 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SEC23BQ15437 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SEC23BQ15437 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SEC23BQ15437 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SEC23BQ15437 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
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