Protein–RNA interactions for Protein: Q14651

PLS1, Plastin-1, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLS1Q14651 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PLS1Q14651 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PLS1Q14651 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PLS1Q14651 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PLS1Q14651 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PLS1Q14651 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PLS1Q14651 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PLS1Q14651 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PLS1Q14651 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PLS1Q14651 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PLS1Q14651 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
PLS1Q14651 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PLS1Q14651 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PLS1Q14651 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PLS1Q14651 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PLS1Q14651 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PLS1Q14651 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PLS1Q14651 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PLS1Q14651 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PLS1Q14651 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PLS1Q14651 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PLS1Q14651 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PLS1Q14651 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PLS1Q14651 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PLS1Q14651 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PLS1Q14651 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PLS1Q14651 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PLS1Q14651 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PLS1Q14651 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PLS1Q14651 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PLS1Q14651 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PLS1Q14651 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PLS1Q14651 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PLS1Q14651 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PLS1Q14651 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PLS1Q14651 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PLS1Q14651 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PLS1Q14651 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PLS1Q14651 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PLS1Q14651 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PLS1Q14651 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PLS1Q14651 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PLS1Q14651 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PLS1Q14651 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PLS1Q14651 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PLS1Q14651 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PLS1Q14651 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PLS1Q14651 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PLS1Q14651 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PLS1Q14651 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PLS1Q14651 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PLS1Q14651 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PLS1Q14651 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PLS1Q14651 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PLS1Q14651 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
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PLS1Q14651 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PLS1Q14651 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PLS1Q14651 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PLS1Q14651 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PLS1Q14651 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PLS1Q14651 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
PLS1Q14651 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PLS1Q14651 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PLS1Q14651 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PLS1Q14651 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PLS1Q14651 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PLS1Q14651 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PLS1Q14651 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PLS1Q14651 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PLS1Q14651 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PLS1Q14651 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PLS1Q14651 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
PLS1Q14651 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PLS1Q14651 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PLS1Q14651 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PLS1Q14651 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PLS1Q14651 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PLS1Q14651 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PLS1Q14651 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PLS1Q14651 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PLS1Q14651 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PLS1Q14651 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PLS1Q14651 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PLS1Q14651 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PLS1Q14651 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PLS1Q14651 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PLS1Q14651 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PLS1Q14651 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PLS1Q14651 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PLS1Q14651 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PLS1Q14651 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PLS1Q14651 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PLS1Q14651 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PLS1Q14651 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PLS1Q14651 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PLS1Q14651 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PLS1Q14651 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PLS1Q14651 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PLS1Q14651 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
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