Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GBX1Q14549 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GBX1Q14549 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
GBX1Q14549 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GBX1Q14549 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GBX1Q14549 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GBX1Q14549 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1□□□□□ -2.25
GBX1Q14549 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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GBX1Q14549 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GBX1Q14549 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
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GBX1Q14549 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GBX1Q14549 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GBX1Q14549 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GBX1Q14549 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GBX1Q14549 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GBX1Q14549 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GBX1Q14549 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GBX1Q14549 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
GBX1Q14549 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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GBX1Q14549 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GBX1Q14549 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GBX1Q14549 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GBX1Q14549 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GBX1Q14549 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GBX1Q14549 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GBX1Q14549 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GBX1Q14549 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GBX1Q14549 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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GBX1Q14549 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GBX1Q14549 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GBX1Q14549 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GBX1Q14549 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GBX1Q14549 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GBX1Q14549 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
GBX1Q14549 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GBX1Q14549 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GBX1Q14549 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GBX1Q14549 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GBX1Q14549 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GBX1Q14549 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GBX1Q14549 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GBX1Q14549 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GBX1Q14549 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GBX1Q14549 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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GBX1Q14549 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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GBX1Q14549 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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GBX1Q14549 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
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GBX1Q14549 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GBX1Q14549 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GBX1Q14549 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GBX1Q14549 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GBX1Q14549 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GBX1Q14549 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GBX1Q14549 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GBX1Q14549 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GBX1Q14549 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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GBX1Q14549 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GBX1Q14549 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
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GBX1Q14549 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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GBX1Q14549 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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GBX1Q14549 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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GBX1Q14549 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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GBX1Q14549 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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GBX1Q14549 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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GBX1Q14549 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GBX1Q14549 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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