Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HDAC1Q13547 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HDAC1Q13547 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HDAC1Q13547 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HDAC1Q13547 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HDAC1Q13547 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HDAC1Q13547 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
HDAC1Q13547 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HDAC1Q13547 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
HDAC1Q13547 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HDAC1Q13547 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HDAC1Q13547 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HDAC1Q13547 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HDAC1Q13547 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HDAC1Q13547 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HDAC1Q13547 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HDAC1Q13547 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HDAC1Q13547 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HDAC1Q13547 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HDAC1Q13547 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HDAC1Q13547 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
HDAC1Q13547 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
HDAC1Q13547 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HDAC1Q13547 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HDAC1Q13547 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HDAC1Q13547 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HDAC1Q13547 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HDAC1Q13547 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
HDAC1Q13547 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HDAC1Q13547 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HDAC1Q13547 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HDAC1Q13547 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
HDAC1Q13547 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HDAC1Q13547 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
HDAC1Q13547 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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