Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
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TRAF3Q13114 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
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TRAF3Q13114 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TRAF3Q13114 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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TRAF3Q13114 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TRAF3Q13114 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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TRAF3Q13114 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TRAF3Q13114 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TRAF3Q13114 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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TRAF3Q13114 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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TRAF3Q13114 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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TRAF3Q13114 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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TRAF3Q13114 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TRAF3Q13114 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
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TRAF3Q13114 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TRAF3Q13114 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
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TRAF3Q13114 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TRAF3Q13114 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TRAF3Q13114 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TRAF3Q13114 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TRAF3Q13114 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TRAF3Q13114 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
TRAF3Q13114 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TRAF3Q13114 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TRAF3Q13114 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TRAF3Q13114 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TRAF3Q13114 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TRAF3Q13114 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TRAF3Q13114 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TRAF3Q13114 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
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