Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
CHAF1AQ13111 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
CHAF1AQ13111 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHAF1AQ13111 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHAF1AQ13111 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHAF1AQ13111 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHAF1AQ13111 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHAF1AQ13111 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHAF1AQ13111 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHAF1AQ13111 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHAF1AQ13111 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CHAF1AQ13111 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CHAF1AQ13111 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CHAF1AQ13111 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CHAF1AQ13111 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CHAF1AQ13111 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CHAF1AQ13111 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CHAF1AQ13111 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CHAF1AQ13111 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CHAF1AQ13111 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CHAF1AQ13111 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CHAF1AQ13111 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CHAF1AQ13111 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CHAF1AQ13111 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CHAF1AQ13111 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CHAF1AQ13111 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CHAF1AQ13111 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CHAF1AQ13111 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHAF1AQ13111 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHAF1AQ13111 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHAF1AQ13111 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHAF1AQ13111 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHAF1AQ13111 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHAF1AQ13111 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHAF1AQ13111 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHAF1AQ13111 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CHAF1AQ13111 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CHAF1AQ13111 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CHAF1AQ13111 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CHAF1AQ13111 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CHAF1AQ13111 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CHAF1AQ13111 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CHAF1AQ13111 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CHAF1AQ13111 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CHAF1AQ13111 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
CHAF1AQ13111 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CHAF1AQ13111 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CHAF1AQ13111 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CHAF1AQ13111 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CHAF1AQ13111 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CHAF1AQ13111 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CHAF1AQ13111 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CHAF1AQ13111 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CHAF1AQ13111 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CHAF1AQ13111 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CHAF1AQ13111 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CHAF1AQ13111 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CHAF1AQ13111 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CHAF1AQ13111 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.02□□□□□ -2.25
CHAF1AQ13111 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CHAF1AQ13111 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CHAF1AQ13111 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CHAF1AQ13111 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CHAF1AQ13111 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CHAF1AQ13111 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CHAF1AQ13111 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CHAF1AQ13111 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CHAF1AQ13111 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CHAF1AQ13111 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CHAF1AQ13111 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CHAF1AQ13111 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CHAF1AQ13111 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CHAF1AQ13111 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CHAF1AQ13111 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CHAF1AQ13111 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CHAF1AQ13111 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CHAF1AQ13111 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CHAF1AQ13111 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CHAF1AQ13111 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CHAF1AQ13111 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CHAF1AQ13111 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
CHAF1AQ13111 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHAF1AQ13111 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHAF1AQ13111 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHAF1AQ13111 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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